MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015850	TGCC	2	8	516656	516663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_015850	GGT	2	6	516984	516989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015850	TATC	2	8	517376	517383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_015850	GGC	2	6	517413	517418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015850	TCGAC	2	10	517442	517451	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1006	NC_015850	GCC	2	6	517453	517458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_015850	GTC	2	6	517704	517709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015850	CGG	2	6	517714	517719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015850	CGG	2	6	517773	517778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015850	CGG	2	6	517816	517821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015850	CCTG	2	8	517823	517830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_015850	CGG	2	6	517951	517956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015850	CAT	2	6	518004	518009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015850	AT	3	6	518018	518023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015850	ATTG	2	8	518085	518092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015850	CGG	2	6	518115	518120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015850	AAT	2	6	518215	518220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015850	ATT	2	6	518221	518226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015850	AGC	2	6	518307	518312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015850	CCTTG	2	10	518324	518333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1021	NC_015850	AGAT	2	8	518395	518402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015850	GTG	2	6	519774	519779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015850	GAG	2	6	519918	519923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015850	GTT	2	6	520613	520618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015850	CACTG	2	10	520627	520636	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_015850	AACCTG	2	12	522348	522359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015850	CCG	2	6	522367	522372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_015850	CAG	2	6	522384	522389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015850	ACG	2	6	522450	522455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015850	CCTG	2	8	523275	523282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_015850	GTC	2	6	523306	523311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015850	GGC	2	6	523322	523327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015850	AG	3	6	524899	524904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015850	CTG	2	6	529241	529246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015850	A	6	6	529249	529254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015850	TCGG	2	8	529259	529266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_015850	AAT	2	6	529279	529284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015850	G	8	8	529329	529336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015850	ATCC	2	8	529470	529477	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015850	GCC	2	6	529526	529531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_015850	CGC	2	6	529535	529540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015850	CGG	2	6	529607	529612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015850	GCC	2	6	529809	529814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015850	CGC	2	6	529818	529823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_015850	CTTGTC	2	12	531292	531303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015850	ATT	2	6	531311	531316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015850	ACT	2	6	532391	532396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015850	TG	3	6	534683	534688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015850	GCTT	2	8	534729	534736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_015850	A	6	6	534746	534751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015850	A	6	6	534785	534790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015850	CAG	2	6	534806	534811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015850	GC	3	6	536328	536333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015850	CGA	2	6	536414	536419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015850	ACC	2	6	536447	536452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015850	CAC	2	6	536473	536478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_015850	CGC	2	6	537968	537973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_015850	CGG	2	6	537998	538003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015850	CGG	2	6	538093	538098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015850	GCA	2	6	538116	538121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015850	GAG	2	6	538164	538169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015850	CTG	2	6	539523	539528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015850	CGG	2	6	544171	544176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015850	G	6	6	544232	544237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015850	TGC	2	6	544238	544243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015850	CCT	2	6	545396	545401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_015850	GCG	2	6	545429	545434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015850	CGGA	2	8	546905	546912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_015850	TCAT	2	8	547002	547009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_015850	TAGCA	2	10	547015	547024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1071	NC_015850	GGC	2	6	547035	547040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015850	CAG	2	6	547127	547132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_015850	GAG	2	6	547174	547179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015850	GCCC	2	8	548718	548725	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1075	NC_015850	ATC	2	6	548750	548755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015850	GCG	2	6	548768	548773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015850	GCA	2	6	548787	548792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015850	TA	3	6	548795	548800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015850	CGG	2	6	554095	554100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015850	GTG	3	9	554154	554162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015850	CGG	2	6	554194	554199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015850	CG	3	6	554253	554258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_015850	GTGGC	2	10	554314	554323	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1084	NC_015850	CG	4	8	554350	554357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_015850	GC	3	6	554363	554368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_015850	GGCGT	2	10	554374	554383	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1087	NC_015850	CCGT	2	8	554412	554419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_015850	GCCTCC	2	12	554424	554435	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_015850	GTCGCG	2	12	555679	555690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015850	TGGT	2	8	555742	555749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015850	TCC	2	6	557963	557968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015850	TTG	2	6	558046	558051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015850	GGCA	2	8	558145	558152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_015850	CCAA	2	8	558198	558205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_015850	CAGAG	2	10	558652	558661	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1096	NC_015850	CAAG	2	8	559267	559274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_015850	ATCT	2	8	559296	559303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_015850	CG	4	8	559399	559406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_015850	GCCA	2	8	559423	559430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_015850	GAG	2	6	559514	559519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015850	TCG	2	6	559567	559572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_015850	CTT	2	6	559869	559874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015850	ACG	2	6	561134	561139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015850	CATA	2	8	561182	561189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_015850	AGAA	2	8	563163	563170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015850	CCT	2	6	563174	563179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_015850	CGG	2	6	563672	563677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015850	CGA	2	6	563711	563716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015850	TCC	2	6	563897	563902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015850	AG	3	6	563944	563949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015850	AAT	2	6	566711	566716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015850	TCT	2	6	566738	566743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015850	TGC	2	6	566766	566771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_015850	GTG	2	6	566774	566779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015850	GCC	2	6	566789	566794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_015850	AAT	2	6	567160	567165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015850	CCG	2	6	567179	567184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_015850	CTG	2	6	567190	567195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_015850	CAAG	2	8	567223	567230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_015850	ATC	2	6	567263	567268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015850	GAC	2	6	567316	567321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015850	GCC	2	6	567350	567355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_015850	T	7	7	567438	567444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015850	AGAAA	2	10	567446	567455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015850	ATG	2	6	567458	567463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015850	CCA	2	6	567530	567535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_015850	AC	3	6	567549	567554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015850	CTTC	2	8	568747	568754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_015850	TCC	2	6	568996	569001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_015850	TGC	2	6	569017	569022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015850	AGT	2	6	569119	569124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015850	GC	3	6	569148	569153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1133	NC_015850	GAT	2	6	569222	569227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015850	CGGTT	2	10	569277	569286	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_015850	TGA	2	6	569394	569399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015850	TGC	2	6	569434	569439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_015850	GGA	2	6	569446	569451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_015850	ATC	2	6	570149	570154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_015850	GTC	2	6	570159	570164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_015850	GTAA	2	8	570186	570193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_015850	AATA	2	8	571617	571624	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_015850	TCA	2	6	571717	571722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_015850	TGG	2	6	571734	571739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_015850	GTA	2	6	571833	571838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_015850	TG	3	6	571865	571870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_015850	G	6	6	571896	571901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_015850	AG	3	6	571918	571923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_015850	AGCC	2	8	571926	571933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1149	NC_015850	CGA	2	6	571939	571944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1152	NC_015850	CTG	2	6	572035	572040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_015850	CGGAT	2	10	572071	572080	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1154	NC_015850	GTT	2	6	572708	572713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1156	NC_015850	GTT	2	6	572875	572880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_015850	T	6	6	573036	573041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1160	NC_015850	TCG	2	6	573730	573735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1162	NC_015850	GGC	2	6	573872	573877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1169	NC_015850	TGG	2	6	580633	580638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1170	NC_015850	T	6	6	580645	580650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1171	NC_015850	GAG	2	6	580651	580656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_015850	GC	3	6	583685	583690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1173	NC_015850	AG	3	6	583691	583696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1174	NC_015850	GTG	2	6	585290	585295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_015850	TCG	2	6	586334	586339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1176	NC_015850	GC	3	6	586366	586371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1181	NC_015850	CAGC	2	8	593067	593074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1182	NC_015850	GAC	2	6	593076	593081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1211	NC_015850	CG	3	6	602198	602203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1254	NC_015850	A	7	7	641197	641203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_015850	AAT	2	6	641234	641239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_015850	TTTG	2	8	641399	641406	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_015850	CAGTTC	2	12	641491	641502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_015850	AC	3	6	641733	641738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1268	NC_015850	GGT	2	6	641744	641749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1271	NC_015850	TCC	2	6	645656	645661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1397	NC_015850	AGACG	2	10	710137	710146	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1406	NC_015850	CTG	2	6	710784	710789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_015850	TA	3	6	710831	710836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_015850	GGC	2	6	710866	710871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1422	NC_015850	CTGG	2	8	718622	718629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1423	NC_015850	TA	3	6	718632	718637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_015850	GCG	2	6	732076	732081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1436	NC_015850	GTG	2	6	737898	737903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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